Lanzada al mercado el 21 de octubre de 1998, la Game Boy Color agregó una pantalla en color y sus dimensiones eran ligeramente mayores que la Game Boy Pocket. Tenía además doble velocidad de procesamiento, una memoria 4 veces mayor que la Game Boy original y un puerto infrarrojo. Tecnológicamente era como la Consola de videojuegos NES de 1983.
Su mayor virtud fue su compatibilidad con los cartuchos de las Game Boy anteriores y hasta poder jugarlos con cierta variedad de colores. Esta compatibilidad se convirtió en la característica esencial en la familia Game Boy, y trajo una gran competencia con lo distintos sistemas del mercado. Los cartuchos especialmente diseñados para la Game Boy Color no podían jugarse en los modelos anteriores de Game Boy , excepto los cartuchos de color negro, aunque físicamente eran del mismo tamaño y forma.
Pokémon llegaría en esta generación a América y sería el título que llevaría a la gloria a la Game Boy Color, Pokémon se convertiría en poco tiempo en el juego más popular de todos los tiempos para los portátiles de Nintendo, a semejanza de las series de Super Mario para las consolas caseras, por lo que se hicieron varias Game Boy Color con diseños especiales de Pokémon, como la Game Boy Color con carcasa Amarilla frontal y trasero Azul, la Game Boy Color GS y una edición muy rara color verde agua traslúcido y trasero color hueso o crema, todas estas versiones tenían diversos Pokémon alrededor de la pantalla.
